HB101菌株是E. coli K-12菌株和E. coli B菌株的杂合产物(同时也是Stbl3的原始菌株)。该菌株携带recA13突变，可有效抑制长片段末端重复区的重组，降低错误重组的概率；但由于其不含核酸酶endA1突变，体内核酸酶含量较高，提取质粒时务必使用质粒提取试剂盒中的去蛋白液以去除核酸酶。hsdS20背景使HB101缺失内切酶系统，增强了外源DNA的稳定性和提取质量；此菌株具有链霉素抗性；不存在lacIqZΔM15，不可用于蓝、白斑筛选。经pUC19质粒转化检测，HB101感受态细胞的转化效率可达107 cfu/μg DNA。