EPI300菌株含有一个突变的trfA基因，该基因表达出的蛋白产物可以促进含有oriV复制子的质粒的高拷贝复制。在非诱导情况下，当含有oriV复制子质粒的EPI300菌株在LB/2YT或SOB培养基中生长时，trfA基因的表达被抑制，oriV复制子质粒的拷贝数维持在很低的水平；当在培养基中加入诱导剂CopyMore 300 (#96001)时，oriV复制子质粒的拷贝数可维持在很高的水平，提高了质粒产量。[mrr-hsdRMS-mcrBC]基因型使EPI300菌株适合于克隆富含甲基胞嘧啶或甲基腺嘌呤的DNA(例如：哺乳动物基因组DNA)。recA1和 endA1的突变有利于插入DNA的稳定和高纯度质粒DNA的提取。lacZΔM15标记的存在使EPI300可用于蓝白斑筛选，rpsL赋予其链霉素抗性。因此，EPI300菌株特别适合于各种不稳定DNA或在常规菌株中得率偏低的质粒克隆。经pUC19质粒转化检测，EPI300感受态细胞的转化效率可达108 cfu/μg DNA。