XL1-Blue菌株能保证高拷贝质粒稳定复制，recA1和endA1的突变有利于插入DNA的稳定和高纯度质粒DNA的提取。hsdR17突变导致EcoK核酸内切酶系统缺失，增强了外源DNA的稳定性和提取质量。 lacIqZΔM15 的存在使XL1-Blue菌株可用于蓝、白斑筛选。此菌株具有四环素抗性。使用pUC19质粒检测，转化效率可达107 cfu/μg。